来源: 阅读： 2022-05-23 09:03:09
编者按
细胞是生命体的最小组成单位,细胞内蛋白质组丰度的动态变化对各种生命过程有重要影响。传统的蛋白组学是针对组织或者大量细胞样本进行分析,获得的是均质化后的结果,掩盖了单细胞的个体差异。单细胞蛋白组可对单个细胞蛋白进行定性定量分析,实现细胞异质性研究,揭示细胞个体之间的精细差异,对细胞及肿瘤异质性分析、特定细胞类型分析、循环肿瘤细胞(CTC)分析、免疫研究和微量/稀有样本研究提供了强大的分析手段。
鹿明生物蛋白部建立了基于tims TOF Pro2平台的单细胞蛋白组分析方案,实验采用流式分选仪对细胞进行特定类群或特定个数进行分群,选用目前灵敏度和扫描速度最高的tims TOF Pro2 4D蛋白组平台进行检测,采用无偏差的DIA模式(Data independent acquisition,数据非依赖性采集模式)进行数据采集并提供蛋白定性定量结果,为客户提供了从百细胞分选到百细胞蛋白质组学检测的一站式服务,通过蛋白质层面的检测,最接近细胞的调控本质,能够更加深刻和准确理解疾病的根本原因,在肿瘤、免疫以及生殖发育领域都具有极大的研究价值。
技术流程
生物新鲜样本——单细胞悬液制备——细胞分选——样本前处理(显微切割样本/微量样本)——质谱检测——生信分析
产品优势
1.多:基于质谱平台检测,通量高、不受样品数量的限制;
2.快:采用最新的tims TOF Pro2平台,结合Evoseq实现更快更深更准的检测;
3.精:可实现低至单个细胞的蛋白定性定量分析,揭示细胞个体之间的精细差异;
4.准:采用DIA全景式质谱扫描,有利于低丰度蛋白检测和准确定量;
5.全:蛋白鉴定种类全,不受抗体的可用性和特异性限制;
6.深:可对极微量/珍稀样本进行高深度蛋白组检测;
应用领域
肿瘤异质性和抗药性研究
微量/稀有样本研究
循环肿瘤细胞(CTC分析)
疾病分子分型研究
细胞异质性研究
特定细胞类型分析
免疫研究
遗传发育细胞周期分析
服务优势
一站式服务
提供单细胞样本制备,分选、蛋白组检测及分析一站式服务
领先的仪器软件
采用先进的布鲁克tims TOF pro2质谱仪及专业分析软件
超高灵敏度和覆盖度
先进的仪器结合自主研发的极微量样本处理体系,提升蛋白鉴定数量
超高稳定性和可靠性
标准的操作流程及严格的质控,保证数据的稳定性、重复性、可靠性
丰富的分析内容
具有专业、成熟的生物信息分析团队、提供全面丰富的分析内容
单细胞多组学联合分析
基于多组学研究平台优势,从不同组学层面进行联合深入分析挖掘
数据结果展示及分析内容展示
补充说明
1.本实验无法进行蛋白定量及SDS-PAGE质检,如果为已经分选好直接上机的样本,请务必保证细胞准确计数。
2.如需要公司提供流式分选服务的请务必提前进行咨询沟通方案及费用。
3.单类群细胞分选细胞数量建议≥103个,如需要使用更少细胞请提前咨询。
参考文献
1.Vivien M et al., A dream of single-cell proteomics. Nature Methods, 2019.
2. Kelly RT et al., Single-cell Proteomics: Progress and Prospects. Mol Cell Proteomics, 2020.
3. Zhu Y et al., Single-cell proteomics reveals changes in expression during hair-cell developmente. Elife, 2019.
4. Andreas DB et al., Ultra-high sensitivity mass spectrometry quantifies single-cell proteome changes upon perturbation. Nature Communications, 2021.
5. Gebreyesus ST., Streamlined single-cell proteomics by an integrated microfluidic chip and data-independent acquisition mass spectrometry. Nature Communications, 2022
鹿明公司简介
鹿明生物成立以来一直专注于生命科学和生命技术领域,在蛋白组领域超过10年的技术沉淀及不断研发创新,已成为国内早期开展蛋白质组且提供优质技术服务的领先者,特别是随着布鲁克tims TOF 4D蛋白质组质谱平台的引进,大幅提高的质谱平台的性能,随着4D质谱平台进行研发技改引领了蛋白组检测的新标准,并基于tims TOF平台成功研发了单细胞蛋白质组技术服务,为低至单个细胞的极微量蛋白质组研究提供强大的分析工具。
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文章来源于欧易生物旗下子公司鹿明生物
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